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传统细菌培养法与荧光PCR法分离公共场所嗜肺军团菌结果比较

时间:2022-11-08 10:35:06 公文范文 来源:网友投稿

【摘要】 目的:对公共场所环境样本(水、土壤、气溶胶)进行嗜肺军团菌监测,掌握南京市公共场所中军团菌的污染情况和菌型分布。方法:对12家商场、医院中央空调系统采集水样(冷却水、景观水、淋浴水、自来水),土壤类样品(背景土、花卉土、风管积尘、景观土),采用传统细菌培养法及荧光PCR法进行嗜肺军团菌的分离鉴定。结果:12家单位共采样234份(水样88份、土壤146份),传统细菌培养法检出嗜肺军团菌9份(主要类型为Lp1型),检出率为3.85%;而实时荧光PCR法检出47份阳性(主要类型为Lp1型),检出率为20.08%。两者检出阳性率比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论:南京市公共场所存在嗜肺军团菌污染,荧光PCR法总检出率明显高于传统细菌培养法,荧光PCR方法较培养法灵敏性较好。

【关键词】 嗜肺军团菌; 荧光PCR法; 公共场所

【Abstract】 Objective: To monitor the Legionella pneumophila of public environmental samples (water, soil, aerosol), and grasp the pollution situation and strains of Legionella pneumophila in public places in Nanjing city distribution.Method: Samples in water and soils of twelve stores and hospitals were collected, Legionella pneumophila were detected and identified by tradtional culture and real-time PCR. Result: 234 samples were collected(water 88 samples, soil 146 samples) and 9 Legionella pneumophila strains were isolated used culture methods (the main type of Lp1 type), the detection rates of pneumophila was 3.85%. while 47 samples were tested positive using Real-time PCR(the main type of Lp1 type). The detection rates of pneumophila were 20.08%. The detection rate of positive comparative difference was statistically significant (P<0.05). Conclusion: Legionella pneumophila are existed in public places of Nanjing. Legionella pneumophila detection rate is higher by Real-time PCR than traditional culture, and it is more sensitive than culture methods.

【Key words】 Legionella pneumophila; Real-time PCR; Public places

据美国疾病预防控制中心报道,普通肺炎中约15%由嗜肺军团菌(Lp)感染引起,军团菌肺炎中约85%由Lp1引起。最近的研究表明,在社区获得性肺炎中嗜肺军团菌为第2位的病因。我国福建、浙江、广东、河北、新疆等省市曾有过该病病例报道,卫生部关于2006年生活饮用水和重点公共场所卫生监督检查情况的通报中,对全国1060家宾馆饭店的集中空调通风系统进行检测,其中检测冷却塔1016个,冷却水中军团菌检出率高达24.5%。国际上,多个国家已将军团菌肺炎定为法定传染病之列,WHO也将其列入传染病报告范围[1-2]。

传统的公认的细菌培养法因取材多为痰标本,培养时间少则3~4 d,多则1~2周,不仅费时、费力,而且培养过程中因生长较慢,极易被其他杂菌污染而出现假阴性。荧光PCR因特异、灵敏的特点已成为临床检测军团菌必不可少的方法之一[3-4]。本研究通过对公共场所环境样本(水、土壤、气溶胶)进行军团菌监测调查,掌握南京市公共场所中嗜肺军团菌的污染情况和菌型分布,建立环境水、土壤和气溶胶类型样品中嗜肺军团菌分离鉴定方法,现报告如下。

1 材料与方法

1.1 试剂 军团菌基础培养基(BCYE)、选择培养基培(GVPC)(北京陆桥)、军团菌诊断血清(日本生研)、军团菌、嗜肺军团菌荧光PCR试剂盒(上海之江生物科技有限公司);核酸(DNA/RNA双提)全自动提取试剂盒(台湾台塑公司)。

1.2 仪器 台式高速冷冻离心机(Eppendorf,Germany),CO2培养箱(NAPCO2IN 5420-1),集菌器(Millpore EZ-Par)。荧光定量PCR仪(ABI,7500 Fast Real-PCR System 16522)全自动核酸提取仪(台湾台塑,MeDiPro SuperPure System-32 D32035)。

1.3 方法

1.3.1 采样数量 对12家商场、医院中央空调系统采集水样88份(包括冷却水、景观水、淋浴水、自来水),土壤类样品146份(包括背景土、花卉土、风管积尘、景观土);环境采样共计234份,均在2012年8-10月进行。

1.3.2 样品处理 (1)水样本:将500 mL水样无菌操作倒入膜过滤系统中,通过孔径0.45 μm滤膜过滤。取下滤膜置于已加入15 mL无菌蒸馏水和适量灭菌玻璃株的50 mL无菌离心管中,放在振荡器上振荡1 min。(2)土壤样品:对背景土、花卉土、景观土进行洗脱分离,将样品充分均匀,称取5 g,无菌操作倒入预先灭菌并装有适量玻璃珠的锥形瓶中,随后加入45 mL含有0.01%吐温80的0.2M PBS,置振荡器上200~300 r/min,震荡20~30 min,静置15 min;对风管积尘样品进行洗脱分离,将样品充分均匀,称取0.5 g,无菌操作倒入预先灭菌并装有适量玻璃珠的大试管(容量30 mL)中,随后加入4.5 mL含有0.01%吐温80的0.2M PBS,置振荡器上200~300 r/min,震荡2~30 min,静置15 min。

1.3.3 传统培养法 按卫监督发[2006]第58号《公共场所集中空调通风系统卫生规范》进行传统培养。

1.3.4 荧光定量PCR法测定 (1)核酸提取方法:DNA提取采用全自动核酸提取仪,按MeDiPro SuperPure System-32操作步骤说明进行。纯化核酸的析出溶液放入经高温高压灭菌及RNase-free的干净EP管中;嗜肺军团菌荧光PCR试剂盒,依据试剂盒操作说明书进行。(2)荧光定量PCR扩增体系和反应条件:总反应体系为25 µL,包括PCR反应液19.5µL,混合酶液(Tap酶+UNG酶)0.5 µL,模板DNA 5 µL;反应条件为UNG处理(50 ℃ 2 min)1个循环;预变性(95 ℃ 3 min)1个循环,PCR 95 ℃ 5 s,55 ℃ 60 s,40个循环(此阶段结束时采集荧光信号)。(3)荧光定量PCR结果判定:荧光定量PCR检测以Ct值<30,并且扩增曲线呈S型为阳性判定原则;Ct值30~35需要重复实验,2次实验均能得到良好S型扩增曲线方可判定为阳性;Ct值>35或无Ct值为阴性。

1.4 统计学处理 应用PEMS 3.1统计学软件对数据进行处理,计数资料比较采用 字2检验,以P<0.05表示差异有统计学意义

2 结果

234份(水样88份,土壤146份)样品中,传统细菌培养法检出嗜肺军团菌9份(主要类型为Lp1),检出率为3.85%;而实时荧光定量PCR法检出47份(主要类型为Lp1),检出率为20.08%。荧光定量PCR法总检出率明显高于传统细菌培养法,有较好的灵敏性(P<0.05),见表1。

3 讨论

在我国的大中城市,随着集中空调系统和供水系统的广泛应用,军团菌病的暴发或者流行的危险性也越来越大。国内文献显示我国不同城市的军团菌检出率差别较大,北京市在1998-2006年的公共场所军团菌检出率达14.07%[5]。上海市在2009年医院嗜肺军团菌检出率达到17.1%[6],广州市2006-2010年公共场所的嗜肺军团菌检出率为15.51%[7],而我市2012年公共场所的嗜肺军团菌检出率为20.1%(荧光定量PCR 法主要分布在冷却水中),细菌培养法检出率为3.85%且均在水中,土壤中未分离到,表明空调冷却水是本市嗜肺军团菌的主要污染水体。

本次实验采用培养法和荧光PCR法进行嗜肺军团菌检测比较,PCR法检出率(20.08%)远高于培养法(3.85%),差异有统计学意义(P<0.05),表明PCR法更为灵敏。但自1976年军团菌被发现以来,对嗜肺军团菌最为肯定的诊断方法还是分离培养,嗜肺军团菌诊断检测的金标准仍为分离培养。由于嗜肺军团菌培养所需培养基组成成分复杂,需要L半胧氨酸、活性炭、含铁物质等成分、培养时间较长(3~7 d)、需要CO2培养箱,并且由于其他杂菌的过分生长而难以从临床和环境标本中分离出来,故不适用于早期诊断。快速准确地应对由嗜肺军团菌引起的不明原因呼吸道疾病,需要两种方法的有机结合,该方法的建立为我国呼吸道传染病预防控制工作提供技术支持[8]。

本次调查所检出嗜肺军团菌的血清型以Lp1型为主,北京、上海、杭州、武汉等地的嗜肺军团菌调查结果是主要型别为Lp1型,其次为Lp5、Lp6型[9],相比之下本市嗜肺军团菌型别分布具有地区特异性。同时,笔者在检测水样中还分离出4株非嗜肺军团菌,4株军团菌(未能分型)。后期结果显示,本市采取定期清洁消毒等措施后,嗜肺军团菌控制效果显著。公共交通系统、商场、宾馆人流量较多,因此减少其通风系统的微生物污染是军团病预防控制工作的重点[10-11]。此外,在宾馆、商场、医院的29份冷却水中检出22份阳性(荧光PCR法),检出率为75.9%,提示冷却水中存在发生军团菌病的可能,应引起足够重视。南京为4大火炉城市之一,气候炎热在梅雨季节又闷热潮湿,夏季持续时间较长,公共场所的集中空调使用频率非常高,充足的阳光和高温环境特别适宜军团菌的生长繁殖。监测工作主要集中在每年的8-10月份。据报道广州等地区一年四季嗜肺军团菌的检出率都较高,尤其在夏秋两季,其中8月份的嗜肺军团菌检出率最高,而春季4月份最低[12]。这与军团菌的最适生长温度(36~42 ℃)有关。

本次监测结果提示,嗜肺军团菌的污染与空调系统频繁使用而导致冷却塔水温升高有关,同时也说明本市外环境水体中嗜肺军团菌存在一定程度污染,此外(依据实时荧光PCR法)外环境土壤中也存在一定污染,但培养法未能分离出,分析原因可能是因为土壤成分复杂,菌量过低,并且杂菌的过快生长也干扰正常细菌的分离。市内高楼大厦密集,各空调冷却塔消毒杀菌的时间不统一,军团菌有机会在这些冷却塔之间不断更换宿主,随着空调使用时间的增加,被军团菌污染的冷却塔数量会越来越多[13]。

综上所述,破坏空调冷却塔水中的军团菌微生态环境,是阻断军团菌在空调冷却塔之间的相互传播,防控军团菌的根本措施。

参考文献

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(收稿日期:2014-03-10)(本文编辑:蔡元元)

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